Првобитни становници Француске Гвајане били су амерички домороци. Французи су на то подручје дошли у 17. веку. Тешко су преживели због тропских болести. За кратко време (1809 -1813) Португалци су заузели то подручје, али су убрзо Французи повратили контролу Паришким споразумом.
Француска је користила данас злогласно Ђавоље острво, острво уз обалу Француске Гвајане, као казнену колонију за криминалце. Француска је на острво послала готово 56.000 затвореника, од којих је мало преживело.
1964. године започета је изградња базе свемирских путовања у Француској Гвајани. Данас је Гвајански свемирски центар важан део европске свемирске индустрије.